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噬菌体全基因组测序案例
发表时间:2019-04-19     阅读次数:1601     字体:【

关键字:噬菌体测序,DNA噬菌体全基因组测序,RNA噬菌体全基因组测序


DNA噬菌体全基因组测序——案例1

样品:噬菌斑纯化的DNA噬菌体

目标:DNA噬菌体全基因组测序

项目简述:污水中分离到嗜水气单胞菌噬菌体,按样本准备指南提取核酸(超速离心纯化并核酸酶处理),核酸送至探普进行质量检查后启动建库测序,测序完成后生物信息学处理和拼接注释,该噬菌体基因组大小55kb,数据库中无基因组相似的噬菌体。


RNA噬菌体全基因组测序——案例2

样品:噬菌斑纯化的RNA噬菌体

目标:RNA噬菌体全基因组测序

项目简述:黄河边污泥中分离到猕猴桃菌噬菌体,按样本准备指南提取核酸(超速离心纯化并核酸酶处理),核酸送至探普进行质量检查后启动建库测序,测序完成后生物信息学处理和拼接注释,该噬菌体基因组大小99kb,数据库中无基因组相似的噬菌体。

噬菌体全基因组测序项目一般来自环境分离的噬菌体样品,往往比对不到已知的基因组。而且基因组大小跨度非常大。所以,噬菌体一定要富集纯化且保证完整性。噬菌体测序目的不仅仅是基因组序列,一般还需要基因注释和功能预测。

 
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